Китайские ученые, работающие над отслеживанием происхождения COVID-19, обсуждают последние результаты и решают споры о прозрачности данных



Примечание редактора: На фоне волн бурных дискуссий о происхождении COVID-19 в международном сообществе и недавнего выпуска Китаем нового анализа, собранного на рынке морепродуктов Хуанань в Ухане, репортеры Global Times в пятницу взяли интервью у Лю Цзюня, исследователя из Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний, который также является членом совместной группы экспертов ВОЗ и Китая и Цянь Чжаохуэй из Института биологии патогенов Китайской академии медицинских наук в их последних выводах и обсуждениях, связанных с отслеживанием происхождения COVID-19.

GT: В сообщениях иностранных СМИ утверждалось, что ваша команда удалила данные, загруженные в GISAID, в процессе подачи документа об анализе данных, собранных на рынке морепродуктов Хуанань, это правда?Китайские ученые, работающие над отслеживанием происхождения COVID-19, обсуждают последние результаты и решают споры о прозрачности данных

Лю: Мы отправили первый черновик статьи в журнал Nature в феврале 2022 года, и в процессе подачи и пересмотра наши команды загрузили исходные данные, относящиеся к статье, на платформу обмена данными GISAID (GISAID) в соответствии с международными практика публикации научных статей. Загруженные данные использовались только для обзора и доступа в журнале, и с Nature и GISAID было согласовано, что данные будут обнародованы после официальной публикации статьи. Данные и ссылка доступа всегда были там и не были удалены.

11 марта 2023 г. мы обнаружили, что данные, загруженные на платформу GISAID, были преждевременно опубликованы сотрудниками GISAID до того, как документ был опубликован, и без ведома нашей команды. Узнав об этом, сотрудники нашей команды позвонили на платформу GISAID, чтобы подтвердить ситуацию. Нам сказали, что выпуск был ошибкой сотрудников GISAID. После этого платформа отключила функцию обмена данными, но данные остались на платформе. Ни наша команда, ни платформа не удаляли данные, а ссылки на доступ к данным для просмотра журнала всегда были там.

Последняя версия нашей статьи была опубликована онлайн в журнале Nature 5 апреля, и все исходные данные были опубликованы одновременно в четырех международных и национальных базах данных.

ТГ: каковы основные выводы статьи? Были ли какие-либо новые открытия или материалы, помогающие установить происхождение вируса?

Лю: Секвенирование нуклеиновых кислот и генов 1380 образцов из окружающей среды и замороженных животных, собранных на рынке Хуанань с января по март 2020 года, показало, что все 457 образцов животных, собранных на рынке, дали отрицательный результат на COVID-19. И 73 из 923 проб окружающей среды дали положительный результат на COVID-19, при этом были выделены три штамма вируса. Результаты секвенирования показали, что геном был на 99,9-100 процентов гомологичен геному первых случаев, что позволяет предположить, что эти штаммы вируса были от пациентов, инфицированных COVID-19.

Секвенирование генов образцов из окружающей среды показало обилие фрагментов секвенирования генов человека и обычных продуктов холодовой цепи, таких как свиньи, коровы, куры и утки, продаваемых на рынке, а также небольшое количество фрагментов генов животных, таких как мыши и кошки. . Это еще раз указывает на то, что присутствие COVID-19 на рынке, скорее всего, было от ранних пациентов. Рынок Хуанань был лишь местом вспышки, а не источником. Эти данные также подтверждают отчет об отслеживании происхождения, подготовленный совместно группой экспертов ВОЗ и Китая.

ГТ: Основываясь на данных, загруженных вашей командой в GISAID, некоторые международные эксперты пришли к другому выводу. Как вы думаете, различия связаны с разными методами анализа или по другим причинам?

Лю: Мы не можем исключить возможность того, что разные методы анализа, программное обеспечение и параметры могут привести к разным результатам, но штрих-кодирование ДНК показало наибольшее количество человеческих генов среди образцов окружающей среды, что указывает на то, что загрязнение на рынке, скорее всего, произошло с самого начала. пациенты. Штрих-кодирование ДНК также показало наличие на рынке до его закрытия нескольких животных, включая свиней, коров, кур и уток.

Некоторые эксперты обеспокоены наличием в образцах предполагаемых генов животных, восприимчивых к COVID-19. Однако существующие данные исследований не подтверждают, что животные на рынке были инфицированы COVID-19. Даже если животные были инфицированы, нельзя исключать, что передача вируса от человека к животному произошла после заражения людей. Поскольку время взятия проб у нас было в январе 2020 года, то есть позже времени, когда были зарегистрированы случаи COVID-19, мы полагаем, что вирус, вероятно, попал на рынок через инфекции человека или продукты холодовой цепи, и научная основа для этого так называемая передача от животного к человеку на рынке явно недостаточна.

GT: В некоторых сообщениях СМИ говорится, что данные, загруженные в GISAID, должны были быть опубликованы раньше. Почему команда экспертов не предоставила эти данные раньше и есть ли еще какие-то данные, которыми можно поделиться?

Лю: После вспышки COVID-19 китайские ученые открыто, прозрачно и ответственно проделали большую работу, чтобы проследить происхождение COVID-19 и своевременно поделиться этой информацией. Например, на ранних стадиях вспышки полная последовательность генома коронавируса была загружена на платформу базы данных GISAID, а эпидемиологические исследования ранних случаев также были опубликованы в Медицинском журнале Новой Англии (NEJM).

В начале 2020 года эксперты из Центра контроля заболеваний Китая собрали на рынке образцы как из окружающей среды, так и из животных, которые показали, что все образцы животных дали отрицательный результат, а 73 образца из окружающей среды оказались положительными. Секвенирование генов вируса показало, что они очень гомологичны ранним случаям. Результаты показали, что вирус существовал в окружающей среде в результате заражения ранних случаев, а рынок был местом вспышки на ранних стадиях распространения вируса.

Все данные, которые у нас были на тот момент, были переданы объединенной группе экспертов ВОЗ по отслеживанию происхождения в период с июля 2020 г. по январь 2021 г., и они были всесторонне обсуждены экспертами.

Группа экспертов также посетила рынок в январе 2021 года. Они признали надежность и важность методов отбора проб и тестирования, а также данных и результатов, и включили результаты в отчет ВОЗ по отслеживанию происхождения на этапе I. .

В отчете говорится, что необходимо провести дополнительные исследования, включая штрих-кодирование ДНК образцов с рынка Хуанань. Основываясь на предложениях, китайские эксперты провели соответствующее исследование, которое показало, что штрих-кодирование ДНК не дает каких-либо новых прямых доказательств в отношении отслеживания происхождения, и подтвердило, что предыдущий вывод совместного отчета ВОЗ и Китая по отслеживанию происхождения был научным и объективным.

В феврале 2022 года эксперты Центра контроля заболеваний Китая представили данные о рынке Хуанань в Nature для экспертной оценки, они также были обнародованы через международную платформу препринтов и загружены в GISAID в соответствии с международной практикой. В настоящее время соответствующие данные опубликованы в четырех базах данных в стране и за рубежом, а статья официально опубликована в журнале Nature.

После подготовки совместного отчета по фазе I китайские ученые проделали большую работу по отслеживанию происхождения, и исследование было своевременно опубликовано. Серологические тесты доноров крови в Ухане во второй половине 2019 года были опубликованы в журнале Protein and Cell. Исследование вирусных профилей более 17 000 летучих мышей в Китае, опубликованное в журнале National Science Review, не обнаружило последовательности нового коронавируса или связанных с ним коронавирусов.

ТГ: Есть ли у вас какие-либо комментарии к недавно опубликованной статье Центра по контролю и профилактике заболеваний Китая?

Цянь: Никакие прямые доказательства не могут доказать подлинное происхождение COVID-19, и распространение вируса от летучих мышей к другим животным, а затем от животных к человеку считается одной из возможных гипотез происхождения, но где именно, когда и как процесс произошел пока не ясно.

Все образцы животных, собранные на рынке, как упоминалось в документе, были отрицательными, и только некоторые образцы из окружающей среды дали положительный результат, что, скорее всего, произошло в результате заражения людей COVID-19. Данные из статьи подтверждают мнение о том, что рынок Хуанань мог быть просто усилителем передачи COVID-19, а не местом, где возник COVID-19.

Китайские специалисты очень много работали над изучением происхождения COVID-19, что является чрезвычайно сложной задачей. Недавно несколько стран также обнаружили некоторые коронавирусы летучих мышей, имеющие очень высокую степень гомологии последовательности генома вируса с SARS-CoV-2, что указывает на важность сотрудничества между странами для отслеживания происхождения вируса. В настоящее время точное место передачи зоонозного вируса человеку остается неизвестным и требует дальнейшего изучения.

GT: Некоторые официальные лица в ВОЗ предположили, что правительство Китая не обеспечивает прозрачности данных, связанных с COVID-19, и заявили, что это могло повлиять на глобальное отслеживание происхождения. Каково ваше мнение по этому поводу, и были ли какие-либо трудности в отслеживании происхождения?

Цянь: Насколько я знаю, данные, на которые ссылаются в документе, фактически были в значительной степени включены в совместный отчет ВОЗ и Китая в 2021 году, и соответствующий отчет можно найти в Интернете. Исследователи в Китае очень усердно работали, чтобы проследить происхождение, и продолжали тесно сотрудничать со многими международными экспертами.

Но отследить происхождение вируса — чрезвычайно трудная и сложная задача. Вспышка ВИЧ началась в 1970-х годах, но ее зоонозное происхождение было установлено только в 2014 году, а вирус попал к людям примерно в 1920 году. Вирус Эбола был обнаружен в 1970-х годах, но до сих пор не совсем ясно, как он появился. Места, где происходили вспышки, часто не были местами происхождения вируса, например, грипп 1918 года, ВИЧ и так далее. Коронавирусы летучих мышей, очень похожие на COVID-19, были обнаружены во многих местах мира, и отслеживание происхождения требует тесного сотрудничества между разными странами и регионами.

GT: В некоторых сообщениях СМИ утверждалось, что совместный отчет ВОЗ и Китая об отслеживании происхождения COVID-19 подвергся широкой критике из-за отсутствия исходных данных о ранних случаях заболевания в Китае. Что вы думаете об этом?

Цянь: Я заметил статью в журнале Science, в которой упоминаются эти взгляды, но из того, что я узнал, данные были переданы группе ВОЗ во время совместного расследования ВОЗ и Китая. Основные выводы совместного отчета ВОЗ и Китая заключаются в том, что лабораторное происхождение пандемии было сочтено «крайне маловероятным», а переход от летучих мышей к человеку от промежуточного вида был «наиболее вероятным». Они в значительной степени считаются консенсусом среди основных экспертов в области вирусологии.

Лично я считаю, что результаты этапа I по отслеживанию происхождения, а также профессионализм и международная репутация членов комиссии и ВОЗ следует полностью уважать. Отследить происхождение вируса — чрезвычайно сложная и профессиональная задача. Мы надеемся, что эксперты в стране и за рубежом смогут работать вместе, чтобы решить эту проблему как можно скорее.

Читайте также